Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.
Comment: Migrated to Confluence 4.0

...

Analysis of the effect of dividing genes into 'blocks'

WGCNA, one block

WGCNA, 7 blocks (block size < 600)

Module difference vs. this baseline (% of pairs for which the algorithm disagrees with this baseline on module co-membership):

 

7.5%

Module co-membership comparison (vs. this column as a baseline):
 

1   3   2   5   4   7   6  13  10 16 11  8  0 17 14 15 12 18  9 19 20 22 21
  1  322   5   3   0  16   0  10   0 120  0  3  8  6  0 85 11  9  0 10  0  0  0  1
  5    7 262   3   0   0   3   0   0   0  0 26  0  2  0  8  0  0  0  0  1  0  0  0
  3    1   3 233   1  12   0   3   0   3  0  1 94  8  0  0  0  1  2 47  0  0  0  0
  4    3   1  10 210  10   7   1   0   9  0  3 13  2  0  0  1 37  0  5  0  0  1  3
  2    2   2  57   0 195   0 179   0   0  0  0  9  3  0  0  0  3  0 10  0  0  0  0
  7    2  13   3   0   0 184   0   0   0  0  0  1  0  0  0  0  0  0  7  1  0  0  0
  9    0   0   0   0   1   0   0 120   0  0  0  1  0  0  0  0  0  0  1  0  0  0  0
  11   1   0   0   0   0   0   0   0   0 99  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0
  10  98   0   0   0   5   0   0   0   0  0  0  0  1  0  1  0  0  0  1  0  0  0  0
  8   18   3   0  21   1   0   3   0   4  0 98  0  3  0  5  0  0  0  1  0  0  0  0
  0    0   0   0   0   0   1   0   0   0  0  0  0 94  0  4  0  0  0  0  0  0  0  0
  6   14   0   6   0   2   0   3   0   0  0  0 24 13 91  0  0  0  0 68  0  0  0  0
  14   1   0   0   0   0   0   0   0   1  0  0  0  1  0  0 74  0  0  0  0  0  0  0
  12  18   0   2   0   2   0   0   0   0  0  0  0  0  0  0  0 72  0  0  0  0  0  0
  13  10   0   0   0   0   0   0   0   0  0  0  6  0  0  0  1  3 70  1  0  0  0  0
  15   1  12   2   0   0   0   0   0   0  0  0  0  0  0  0 13  0  0  0 48  0  0  0
  17   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0  0  0  7  0  0  0  0  0  0  0 40  0  0
  18   0   0   0   0   0   0   0   0   0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0  0 34  0
  16  15   8   0   0   0   0   0   0   0  0  0  0  0  0  3  0  0  0  0  0  0  0 32