Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Unequal beta, module diff=44%

Identical beta, module diff=0.9%

   turquoise blue grey
  turquoise      1271  147    0
  blue            648  373    0
  grey             53    0   42

turquoise blue grey
  turquoise      1958    0    0
  blue              0  520    0
  grey             14    0   42

...

Human liver cohort, top 5K genes

Soft Threshold Choice

...

<TBD>

...

p-value

...

Adj R^2

...

Truncated Adj R^2

...

slope

...

mean(k)

...

median(k)

...

max(k)

...

 

...

Power

...

SFT.R.sq

...

slope

...

truncated.R.sq

...

mean.k.

...

median.k.

...

max.k.

...

1

...

-1

...

-0.0645

...

0.877

...

0.289

...

632

...

622

...

1080

...

1

...

1

...

0.0123

...

0.288

...

0.883

...

632

...

622

...

1080

...

1.5

...

-1

...

-0.0291

...

0.911

...

-0.454

...

283

...

272

...

611

...

2

...

1.5

...

0.0733

...

-0.581

...

0.905

...

283

...

272

...

611

...

2

...

-1

...

0.149

...

0.935

...

-0.972

...

140

...

131

...

367

...

3

...

2

...

0.227

...

-0.993

...

0.947

...

140

...

131

...

367

...

2.5

...

-1

...

0.296

...

0.953

...

-1.29

...

74.3

...

66.5

...

231

...

4

...

2.5

...

0.398

...

-1.38

...

0.965

...

74.3

...

66.5

...

231

...

3

...

-1

...

0.416

...

0.956

...

-1.53

...

41.9

...

35.5

...

150

...

5

...

3

...

0.543

...

-1.75

...

0.964

...

41.9

...

35.5

...

150

...

3.5

...

-1

...

0.535

...

0.968

...

-1.67

...

24.9

...

19.9

...

100

...

6

...

3.5

...

0.63

...

-1.86

...

0.966

...

24.9

...

19.9

...

100

...

4

...

-1

...

0.675

...

0.977

...

-1.57

...

15.4

...

11.5

...

68.9

...

7

...

4

...

0.761

...

-1.71

...

0.984

...

15.4

...

11.5

...

68.9

...

4.5

...

-1

...

0.767

...

0.961

...

-1.96

...

9.86

...

6.94

...

57.2

...

8

...

4.5

...

0.817

...

-2.05

...

0.956

...

9.86

...

6.94

...

57.2

...

5

...

-1

...

0.832

...

0.95

...

-2.14

...

6.53

...

4.33

...

48.7

...

9

...

5

...

0.852

...

-2.18

...

0.93

...

6.53

...

4.33

...

48.7

...

5.5

...

-1

...

0.888

...

0.951

...

-2.15

...

4.46

...

2.74

...

41.9

...

10

...

5.5

...

0.904

...

-2.19

...

0.95

...

4.46

...

2.74

...

41.9

...

6

...

-1

...

0.892

...

0.927

...

-2.15

...

3.12

...

1.8

...

36.3

...

11

...

6

...

0.912

...

-2.17

...

0.931

...

3.12

...

1.8

...

36.3

...

6.5

...

-1

...

0.907

...

0.922

...

-2.11

...

2.24

...

1.2

...

31.6

...

12

...

6.5

...

0.951

...

-2.07

...

0.958

...

2.24

...

1.2

...

31.6

...

7

...

-1

...

0.926

...

0.935

...

-2.04

...

1.65

...

0.821

...

27.7

...

13

...

7

...

0.943

...

-2.02

...

0.942

...

1.65

...

0.821

...

27.7

...

7.5

...

-1

...

0.925

...

0.929

...

-1.98

...

1.23

...

0.568

...

24.4

...

14

...

7.5

...

0.967

...

-1.92

...

0.962

...

1.23

...

0.568

...

24.4

...

8

...

-1

...

0.923

...

0.923

...

-1.91

...

0.945

...

0.394

...

21.6

...

15

...

8

...

0.964

...

-1.85

...

0.956

...

0.945

...

0.394

...

21.6

...

8.5

...

-1

...

0.927

...

0.924

...

-1.85

...

0.737

...

0.276

...

19.1

...

16

...

8.5

...

0.978

...

-1.77

...

0.972

...

0.737

...

0.276

...

19.1

...

9

...

-1

...

0.949

...

0.946

...

-1.77

...

0.585

...

0.196

...

17

...

17

...

9

...

0.979

...

-1.7

...

0.973

...

0.585

...

0.196

...

17

...

9.5

...

-1

...

0.964

...

0.961

...

-1.69

...

0.472

...

0.141

...

15.2

...

18

...

9.5

...

0.976

...

-1.65

...

0.969

...

0.472

...

0.141

...

15.2

...

10

...

-1

...

0.962

...

0.958

...

-1.63

...

0.387

...

0.101

...

13.6

...

19

...

10

...

0.974

...

-1.58

...

0.967

...

0.387

...

0.101

...

13.6

...

10.5

...

-1

...

0.942

...

0.938

...

-1.59

...

0.322

...

0.0741

...

12.2

...

20

...

10.5

...

0.971

...

-1.54

...

0.962

...

0.322

...

0.0741

...

12.2

...

11

...

-1

...

0.933

...

0.928

...

-1.54

...

0.272

...

0.0546

...

11

...

21

...

11

...

0.988

...

-1.47

...

0.985

...

0.272

...

0.0546

...

11

...

11.5

...

-1

...

0.935

...

0.93

...

-1.49

...

0.232

...

0.0404

...

9.96

...

22

...

11.5

...

0.989

...

-1.42

...

0.986

...

0.232

...

0.0404

...

9.96

...

12

...

-1

...

0.92

...

0.913

...

-1.45

...

0.201

...

0.0297

...

9.02

...

23

...

12

...

0.991

...

-1.37

...

0.988

...

0.201

...

0.0297

...

9.02

Modules

Unequal beta, module diff=33%:

...

Modules

Unequal beta, module diff=__%

Identical beta, module diff=1.0%

 

grey turquoise blue brown yellow green red black
  grey      3573         0    0     0      0     0   0     0
  turquoise   30       730    0     0      0     0   0     0
  blue         0         0  261     0      0     0   0     0
  brown        0         0    0   136      0     0   0     0
  yellow       0         0    0     0    100     0   0     0
  green        0         0    0     0      0    88   0     0
  red          0         0    0     0      0     0  51     0
  black        0         0    0     0      0     0   0    43

Methylation (full set)

Soft Threshold Choice

...