Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Unequal beta, module diff=44%

identical beta, module diff=0.9%

                  turquoise blue grey
  turquoise      1271  147    0
  blue            648  373    0
  grey             53    0   42

              turquoise blue grey
  turquoise      1958    0    0
  blue              0  520    0
  grey             14    0   42

...

Unequal beta, module diff=11%

identical beta, module diff=0.5%

turquoise blue brown yellow green grey
  turquoise      2655    1    11      0     0    0
 

Human liver cohort, top 5K genes

Soft Threshold Choice

Modules

...

blue             23  950    45    102    57    0
  brown            24   55   423      1     1    0
  yellow          278    4    73      0     0    0
  green             0    9     0    125     1    0
  grey              0    2     0     61     0   26
  red               0   24     0     49     0    0

turquoise blue brown yellow green grey
  turquoise      2980    0     0      0     0    0
  blue              0  997     0      0     0    0
  brown             0    0   552      0     0    0
  yellow            0   48     0    338     0    0
  green             0    0     0      0    59    0
  grey              0    0     0      0     0   26

Human liver cohort, top 5K genes

Soft Threshold Choice

Modules

Unequal beta, module diff=33%:

grey turquoise blue brown yellow green black red
  grey         2938         4    9     3      4     0     1   5
  turquoise      52       346    0     0      0     0     0   0
  blue          177         0  197     0      0     0     0   0
  brown         155         0   17     0      0     0     0   0
  green         134         0    0     1      0     0     0   0
  yellow         77         0    0    70      0     0     0   0
  red            74         0    0     0      0    58     0   0
  pink           30         0    1     0     66     0     0   0
  black          58         0    0    51      0     0     0  13
  purple         52         0    0     0      0     0     0   0
  greenyellow    50         0    0     0      0     0     0   0
  tan            49         0    0     0      0     0     0   0
  magenta        12         0    0     0      0     0    45   0
  salmon         42         0    0     0      0     2     0   0
  midnightblue   37         0    0     0      0     0     0   0
  lightcyan      36         0    0     0      0     0     0   0
  grey60         33         0    0     0      0     0     0   0
  cyan            5         0    0     0      0     0     0  33
  lightgreen     32         0    0     0      0     0     0   0
  lightyellow    31         0    0     0      0     0     0   0 

Methylation (full set)

Soft Threshold Choice

...