Package Comparison Details, by dataset

Female Mouse Liver (UCLA Tutorial)

Modules (3.7% different)

blue green brown red turquoise yellow grey black pink magenta purple greenyellow tan salmon cyan midnightblue lightcyan grey60
  turquoise     522     0     0   0         0    171    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  blue            0   373     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0   39            0         0      0
  brown           0     0   358   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  yellow          0     0     0 331         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  green           0     0     0   0       323      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  red             0     0     0   0         0    256    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  black           0     0     0   0       203      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  grey            0     0     0   0         0      0  168     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  pink            0     0     0   0         0      0    0   134    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  magenta         0     0     0   0         0      0    0     0  122       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  purple          0     0     0   0         0      0    0     0    0     120      0           0   0      0    0            0         0      0
  greenyellow     0     0     0   0         0      0    0     0    0       0     99           0   0      0    0            0         0      0
  tan             0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0          86   0      0    0            0         0      0
  salmon          0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0  76      0    0            0         0      0
  cyan            0     0    72   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0      0
  midnightblue    0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0     43    0            0         0      0
  lightcyan       0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0           37         0      0
  grey60          0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0        34      0
  lightgreen      0     0     0   0         0      0    0     0    0       0      0           0   0      0    0            0         0     33

Cranio Dataset

Soft Threshold Choice

...