Versions Compared

Key

  • This line was added.
  • This line was removed.
  • Formatting was changed.

...

Sage Coexpression, organic correlation algorithm

Sage Coexpression, WGCNA correlation algorithm

WGCNA Coexpression

Unix space ('M' field from /usr/bin/time): 6471520KB (or 6.47GB)

Unix space ('M' field from /usr/bin/time):: 6474832K (6.47GB)

Unix space ('M' field from /usr/bin/time):: 1958480KB (1.96GB)

Unix time('E' field from /usr/bin/time): 14:04.38elapsed

Unix time('E' field from /usr/bin/time):13:33.74elapsed

Unix time('E' field from /usr/bin/time):2:07.23elapsed




Module difference vs. this baseline (% of pairs whose module co-membership is not preserved):


7.4%

 

Module co-membership comparison:

 

 

yellow brown blue green turquoise red black pink magenta grey greenyellow purple tan salmon cyan lightcyan midnightblue
  2     403    11    0     0         0  15     0    0       0   25           0      0   0      0    0         0            0
  3      11   357    0     0         1   6     0    0       0   24           0      0   0      0    0         0            4
  1       1     4  352     1         2 130     0    4       0   16           1     61   0      1    0         0           19
  4       4     6    0   302         0   0     0    0       0    6           0      0   0      0    0         0            1
  5       1     0    2     0       298   1     0    0       0    6           0      3   0      0    0         0            0
  8       0     4    0     0       195   2     0    0       0    2           0      0   0      0    0         0            0
  6       4     3  132    39         5  10     0    0       0   13           0      7   1      0    0         0            0
  9       0     1    0     0         0   0   122    0       0    0           0      0   0      0    0         0            0
  7       0    67    1     2         1   2     0  115       0    9           0      0   0      0    0         0            8
  12      0     0    0     0         0   0     0    0      99    1           0      0   0      0    0         0            0
  11      0     0    0     0         0  99     0    0       0    3           0      1   0      0    0         0            0
  10      0     0    1     3         2  96     0    0       0   10           0      1   0      0    0         0            1
  0       0     0    0     0         0   0     0    0       0   80           0     14  41      0    0         0            1
  15      0     0    0     0         0   0     0    0       0    0          77      0   0      0    0         0            0
  14      1     0    0     0        77   0     0    0       0    2           0      0   0      0    0         0            0
  13      0     6    0    42         0   2     0    1       0    0           0      0   0     39    0         0            1
  16      0     0    0     0         0   0     0    0       0    3           0      0   1      0   37         0            0
  17      0     0    0     0         0   0     0    0       0    0           0      0   0      0    0        34            0